有鑒於近年陸續爆發多起食安事件，邱縣長重視縣內食品安全議題，責成衛生局訂定本縣食品安全管理自治條例，最主要的特色是把食安管理層級從衛生局提升到縣政府，各局處都有相關權責來共同管理食品安全，條文共計19條，訂定重點如下：一、食安管理升級，主管機關提升為新竹縣政府。二、食品業者限時通報，杜絕黑心食品流通於市面，保障民眾飲食安全及消費權益。三、明定含乙型受體素(瘦肉精)之豬肉及其他相關產製品禁止於本縣販售。四、明定境外產品對民眾之身體或健康有造成危害之虞者，授權縣府公告禁止販售或限制販售方式。五、為有效落實農產品安全制度，縣府權責單位得不定期進入農產品經營業者之各類場所，進行檢查或抽驗。六、保障校園食安，訂定供應校園食品業者產製規範。七、警察會同食安稽查。
衛生局表示，無論是豬肉瘦肉精或日本核災食品問題，在無法確保安全無虞之前，均應禁止在縣內販售，除此熱議食安問題，為阻絕未來仍有可能爭議性食品叩關，本自治條例特規範境外食品，並定義境外產品為臺澎金馬以外其他國家、地區，以保障縣民食的安全。
另，由於含糖飲料是造成肥胖、糖尿病以及高血脂等慢性疾病的主要元兇之一，為了小朋友健康，避免國中小及高中職校的老師、家長以含糖飲料獎勵學生，因此也在條例中訂定相關條款，以營造健康的學習環境。
衛生局在多方查詢相關法規資料，縣府各局處多次會議討論後，擬定「新竹縣食品安全管理自治條例草案」，並於新竹縣議會第18屆第5次定期會審議，已於本月26日順利通過。新竹縣衛生局強調，食品安全的管理應與時俱進，法規應與實際面結合，跨局處合作的力量，讓新竹縣食品安全管理更臻完善。
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